Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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