Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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CA9Q16790 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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CA9Q16790 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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CA9Q16790 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CA9Q16790 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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CA9Q16790 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CA9Q16790 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CA9Q16790 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CA9Q16790 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CA9Q16790 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CA9Q16790 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CA9Q16790 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CA9Q16790 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CA9Q16790 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CA9Q16790 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CA9Q16790 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CA9Q16790 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CA9Q16790 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CA9Q16790 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CA9Q16790 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CA9Q16790 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CA9Q16790 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA9Q16790 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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