Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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