Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ZNF239Q16600 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ZNF239Q16600 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ZNF239Q16600 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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ZNF239Q16600 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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