Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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