Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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ZNF56Q15929 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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ZNF56Q15929 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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ZNF56Q15929 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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ZNF56Q15929 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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