Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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