Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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