Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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SIX1Q15475 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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SIX1Q15475 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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SIX1Q15475 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SIX1Q15475 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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SIX1Q15475 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SIX1Q15475 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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SIX1Q15475 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIX1Q15475 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SIX1Q15475 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SIX1Q15475 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SIX1Q15475 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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