Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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