Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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