Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLD3Q15054 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms