Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms