Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GBX1Q14549 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms