Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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