Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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