Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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