Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms