Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms