Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BEX3Q00994 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms