Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CLDN15P56746 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CLDN15P56746 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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