Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIRAP54198 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIRAP54198 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIRAP54198 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms