Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms