Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CRIP1P50238 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CRIP1P50238 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms