Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms