Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms