Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTN2P35609 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms