Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC8A1P32418 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms