Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJB2P29033 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJB2P29033 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms