Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms