Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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