Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNB1P20700 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms