Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRHP20396 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRHP20396 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRHP20396 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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