Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CREB1P16220 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CREB1P16220 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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