Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms