Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COX6A1P12074 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms