Protein–RNA interactions for Protein: P11161

EGR2, E3 SUMO-protein ligase EGR2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR2P11161 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EGR2P11161 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EGR2P11161 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EGR2P11161 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EGR2P11161 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EGR2P11161 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EGR2P11161 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EGR2P11161 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EGR2P11161 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EGR2P11161 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EGR2P11161 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EGR2P11161 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EGR2P11161 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EGR2P11161 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
EGR2P11161 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
EGR2P11161 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
EGR2P11161 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EGR2P11161 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
EGR2P11161 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EGR2P11161 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EGR2P11161 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EGR2P11161 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EGR2P11161 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
EGR2P11161 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms