Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SCN2BO60939 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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SCN2BO60939 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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SCN2BO60939 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCN2BO60939 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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