Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSCO60682 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSCO60682 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSCO60682 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSCO60682 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSCO60682 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSCO60682 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSCO60682 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSCO60682 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSCO60682 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSCO60682 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSCO60682 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSCO60682 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MSCO60682 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MSCO60682 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSCO60682 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSCO60682 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSCO60682 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSCO60682 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSCO60682 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSCO60682 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSCO60682 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSCO60682 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSCO60682 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MSCO60682 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MSCO60682 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms