Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LRRTM2O43300 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms