Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-1B6SEH8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms