Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms