Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRBA1A5PL33 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms