Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQV3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQV3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQV3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQV3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQV3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQV3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQV3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQV3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQV3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQV3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQV3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQV3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQV3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQV3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQV3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQV3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQV3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQV3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQV3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQV3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQV3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQV3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQV3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQV3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQV3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQV3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQV3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQV3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQV3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQV3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQV3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
U3KQV3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQV3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQV3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQV3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQV3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQV3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQV3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQV3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQV3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQV3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQV3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQV3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQV3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQV3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQV3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQV3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQV3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQV3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQV3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQV3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQV3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQV3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQV3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQV3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQV3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQV3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U3KQV3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U3KQV3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
U3KQV3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U3KQV3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
U3KQV3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U3KQV3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
U3KQV3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U3KQV3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U3KQV3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U3KQV3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U3KQV3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U3KQV3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U3KQV3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U3KQV3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
U3KQV3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U3KQV3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U3KQV3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
U3KQV3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQV3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQV3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQV3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQV3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQV3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQV3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQV3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQV3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQV3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQV3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQV3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
U3KQV3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U3KQV3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
U3KQV3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U3KQV3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U3KQV3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U3KQV3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U3KQV3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
U3KQV3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
U3KQV3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U3KQV3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
U3KQV3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms