Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U7

RNF215, RING finger protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF215Q9Y6U7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF215Q9Y6U7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF215Q9Y6U7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms