Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDY1Q9Y6F8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDY1Q9Y6F8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms