Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG1Q9Y678 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPG1Q9Y678 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms