Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR2E3Q9Y5X4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NR2E3Q9Y5X4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NR2E3Q9Y5X4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR2E3Q9Y5X4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR2E3Q9Y5X4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms