Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX5Q9Y5X3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms