Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX8Q9Y5X2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX8Q9Y5X2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms